More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl205 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl205  competence-damage inducible protein  100 
 
 
152 aa  304  3e-82  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.962311  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0552  hypothetical protein  51.91 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  43.05 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0089  competence/damage-inducible protein CinA C- domain  40.27 
 
 
156 aa  106  1e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  43.8 
 
 
412 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  42.15 
 
 
412 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  40.5 
 
 
412 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  40.5 
 
 
412 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  40.5 
 
 
412 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.93 
 
 
433 aa  97.1  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.73 
 
 
424 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  46.73 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  41.96 
 
 
408 aa  96.3  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 
412 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 
412 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  45.95 
 
 
408 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 
412 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  39.67 
 
 
412 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.84 
 
 
412 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  41.33 
 
 
415 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  38.84 
 
 
412 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  36.3 
 
 
416 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf178  competence/damage-inducible protein CinA  45.71 
 
 
136 aa  94  7e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  36.92 
 
 
168 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  36.89 
 
 
414 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  40.18 
 
 
408 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  38.71 
 
 
415 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  44.55 
 
 
413 aa  91.3  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  42.48 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  28.67 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  34.64 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  36.61 
 
 
413 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  39.01 
 
 
423 aa  90.5  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  34.01 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  36.3 
 
 
419 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.55 
 
 
411 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  36.99 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  37.1 
 
 
415 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  34.01 
 
 
165 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  43.24 
 
 
403 aa  88.2  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  37.82 
 
 
414 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  33.33 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  29.53 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  34.01 
 
 
159 aa  87  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  30.92 
 
 
208 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  39.83 
 
 
369 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  31.58 
 
 
202 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  34.68 
 
 
432 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  28.1 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  35.62 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  38.02 
 
 
415 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32 
 
 
431 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  35.07 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  35.07 
 
 
161 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  37.76 
 
 
413 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  31.93 
 
 
175 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  35.62 
 
 
169 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  42.11 
 
 
412 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1729  competence/damage-inducible protein CinA  34.01 
 
 
401 aa  84.3  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  30.26 
 
 
211 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  31.85 
 
 
170 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  30.67 
 
 
166 aa  84  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4984  competence/damage-inducible protein CinA  37.78 
 
 
417 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  37.74 
 
 
420 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  31.21 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  38.03 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  34.67 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  31.08 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  29.33 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  33.9 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  35.94 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  32.21 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  32.24 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  35.51 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  32.24 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.84 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  27.97 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  31.21 
 
 
208 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2526  competence/damage-inducible protein cinA  36.43 
 
 
418 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  42.11 
 
 
412 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  37.27 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  38.79 
 
 
400 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  43.48 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  40.37 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  31.29 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  32.24 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.14 
 
 
411 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  32.39 
 
 
206 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  36.57 
 
 
411 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  32.26 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  31.91 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  36.27 
 
 
401 aa  81.3  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>