More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4154 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  97.99 
 
 		 299 aa  563  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  91.3 
 
 		 299 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  76.92 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  73.74 
 
 		 295 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  72.73 
 
 		 295 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  64.86 
 
 		 296 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  57.04 
 
 		 277 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  54.27 
 
 		 294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  52.71 
 
 		 285 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  52.71 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  52.71 
 
 		 285 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  52.33 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  52.33 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  56.42 
 
 		 282 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  51.55 
 
 		 285 aa  292  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  51.53 
 
 		 281 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  51.55 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  50.78 
 
 		 285 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 322 aa  272  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  52.17 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  48.46 
 
 		 275 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  50.76 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  46.04 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6386  beta-lactamase domain-containing protein  45.29 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 		 244 aa  86.3  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  29.95 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  36.11 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  30.48 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  30.48 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  30.48 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  29.19 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  30.48 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  29.33 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  30.48 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  30.14 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  27.16 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 192 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  31.03 
 
 		 214 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  28.89 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  32.57 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  30.43 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  29.56 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  30.48 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  29.76 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  30.17 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 210 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  32.67 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0019  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.751358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.61 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  27.15 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.22 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  25.64 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.38 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0406  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.9 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  29.22 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.38 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.38 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.38 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.79 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>