80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2352 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2352  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 165 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.125747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2631  ribonuclease P protein component  98.79 
 
 		 165 aa  308  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88975  normal  0.0705179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2309  ribonuclease P protein component  79.29 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  0.100774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5376  ribonuclease P protein  56.2 
 
 		 141 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3504  ribonuclease P protein component  63.78 
 
 		 206 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5080  ribonuclease P protein component  57.63 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.479331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  35.18 
 
 		 227 aa  80.5  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  41.01 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39.86 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  35.66 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  44.04 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  38.18 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  41.96 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  40.54 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  39.84 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  37.5 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  38.74 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  38.6 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  36.97 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  32.84 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  35.34 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0684  ribonuclease P protein component  44.83 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1922  ribonuclease P protein component  41.73 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.239501  normal  0.549748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3075  ribonuclease P protein  47.41 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  26.02 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.63 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.63 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.63 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.63 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.63 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  31.82 
 
 		 116 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  33.08 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0068  ribonuclease P protein component  41.03 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190277  decreased coverage  0.00398675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  25.42 
 
 		 115 aa  51.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  24.39 
 
 		 115 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3704  ribonuclease P protein component  46.55 
 
 		 111 aa  50.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  24.39 
 
 		 115 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.73 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0576  ribonuclease P protein component  35.09 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3615  ribonuclease P protein component  36.61 
 
 		 106 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0375  ribonuclease P  44.14 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.174091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.73 
 
 		 115 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1362  ribonuclease P  40.18 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3337  ribonuclease P protein  44.44 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  32.73 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 116 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  43.08 
 
 		 93 aa  48.5  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  34.58 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.64 
 
 		 116 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7325  ribonuclease P protein component  42.74 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  34.38 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  31.88 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  37.5 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  31.45 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  38.71 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  42.2 
 
 		 116 aa  44.7  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  35.29 
 
 		 121 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  43.75 
 
 		 89 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  28.99 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  32.81 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  35.9 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  33.73 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0637  ribonuclease P protein component  41.23 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150092  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  27.73 
 
 		 115 aa  42  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0439  hypothetical protein  24.55 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00442765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  41.18 
 
 		 120 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  29.27 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  36.07 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  30.48 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  39.62 
 
 		 120 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  26.56 
 
 		 116 aa  41.2  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.05 
 
 		 115 aa  40.8  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  21.43 
 
 		 109 aa  40.4  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0641  ribonuclease P protein component  33.63 
 
 		 148 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244598  normal  0.489939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>