46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0817 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  97.9 
 
 		 238 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  82.16 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  63.33 
 
 		 198 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  60.82 
 
 		 274 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  56.81 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  35.79 
 
 		 183 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  47.29 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  43.59 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  40.84 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  42.64 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  44.33 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  43.81 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  41.24 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  43.48 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  43.48 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  41.24 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  35.61 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  31.1 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  30.62 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.67 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  38.46 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  46.74 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  35.06 
 
 		 561 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  43.48 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  50 
 
 		 421 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  29.51 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  43.48 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  34.85 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  30.56 
 
 		 157 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  29.61 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  31.32 
 
 		 257 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  39.77 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  43.75 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  42.11 
 
 		 292 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  29.89 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  32.03 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  28.4 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  40.91 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  46.24 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  33.96 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  37.29 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  26.8 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7022  hypothetical protein  33.72 
 
 		 345 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.00000183112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>