More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0721 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  96.14 
 
 		 233 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  93.04 
 
 		 230 aa  431  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  53.51 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  40.17 
 
 		 243 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  40.17 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  40.17 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  40.17 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  44.78 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  40.34 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  40.77 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  39.06 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  39.48 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  39.48 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  37.34 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  38.08 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  36.05 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  37.45 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  41.56 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  35.9 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  35.47 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  34.76 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  37.23 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  35.06 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  37.39 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  35.19 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  35.06 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  36.32 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  33.48 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.15 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  34.32 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.61 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  34.26 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  31.96 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  34.41 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.9 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  31.21 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.1 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.43 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  30.98 
 
 		 278 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  32.05 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.94 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  28.33 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  33.85 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  35.88 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.76 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  34.72 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  30.25 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.98 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  30 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  31.88 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  31.46 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  30.91 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  32.26 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  32.85 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  34.07 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  30.53 
 
 		 522 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  31.58 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  29.45 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  30.08 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  26.98 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  29.01 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  35.88 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  30.39 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.22 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  29.17 
 
 		 540 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  29.59 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  32.28 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  33.58 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  33.33 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1009  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  25.47 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0200639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.1 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  32.82 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  30.72 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  28.28 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  31.82 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  31.34 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  28.57 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  31.86 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0948  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component II  25.47 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  27.36 
 
 		 525 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  30.99 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  36.22 
 
 		 512 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  30 
 
 		 537 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  28.57 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>