More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0643 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0643  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
384 aa  781    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1341  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.09 
 
 
384 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0577  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.61 
 
 
384 aa  569  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0261  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  70.31 
 
 
384 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.97 
 
 
427 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.4 
 
 
439 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.23 
 
 
448 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1355  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.53 
 
 
425 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.297533  decreased coverage  0.00000000605303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.47 
 
 
442 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0635526  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2635  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.75 
 
 
430 aa  96.7  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.64 
 
 
452 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.28 
 
 
457 aa  82.8  0.000000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.06 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
468 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2064  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.34 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.99 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.16 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  25.7 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  26.61 
 
 
449 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1690  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.15 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.44 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  30.23 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.39 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.46 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.71 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.23 
 
 
585 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.77 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.16 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.01 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.16 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.55 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.04 
 
 
459 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  25.42 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.16 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.77 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  22.88 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  25.99 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.23 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  26.32 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  23.78 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  25.96 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.78 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.89 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  22.88 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  24.14 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  28.31 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  23.82 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  25.24 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  22.94 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.91 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.8 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  24.16 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  27.55 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.7 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.27 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  25.15 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  23.2 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  28.77 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1337  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  24.52 
 
 
500 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.000372157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.14 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  25.94 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  23.2 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.16 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.97 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  25.08 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
479 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  24.34 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.03 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.14 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
479 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.11 
 
 
487 aa  72.8  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  23.44 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  25.36 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  22.63 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.56 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  26.63 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  25.61 
 
 
460 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  26.19 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.92 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.27 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.84 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.84 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  26.4 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.87 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.11 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  26.2 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  25.93 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  27.07 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.78 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  28.44 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.67 
 
 
464 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.47 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  26 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.76 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  24.69 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.12 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.92 
 
 
722 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  28 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0427  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>