More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0170 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0170  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
459 aa  936    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
476 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
476 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
476 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1992  cysteinyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
419 aa  393  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162619  normal  0.881095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1158  cysteinyl-tRNA synthetase  45 
 
 
419 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
484 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
466 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
468 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
458 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
475 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
487 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
474 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
455 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
476 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2176  cysteinyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
423 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
466 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
466 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
457 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
453 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
486 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
477 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
481 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
457 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
480 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
500 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
474 aa  368  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
465 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
478 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
466 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
479 aa  361  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
465 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
488 aa  360  2e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
494 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
460 aa  360  4e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
458 aa  359  6e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
485 aa  359  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
493 aa  358  8e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
460 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
480 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
459 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
484 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
480 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
459 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
489 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
459 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
466 aa  354  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
490 aa  353  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 
465 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
459 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
466 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
493 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
468 aa  352  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
461 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
485 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
460 aa  351  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
459 aa  350  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
485 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
460 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
461 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
459 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
459 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
479 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
461 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
493 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
490 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
459 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
456 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
469 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
461 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
460 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
459 aa  346  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
457 aa  346  6e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
484 aa  345  8e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
459 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
460 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
460 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
472 aa  345  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
461 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
460 aa  344  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
478 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
459 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
470 aa  343  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
483 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
481 aa  343  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
460 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
461 aa  343  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>