More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1158 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1158  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  869    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1992  cysteinyl-tRNA synthetase  81.15 
 
 		 419 aa  726    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162619  normal  0.881095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2176  cysteinyl-tRNA synthetase  75.89 
 
 		 423 aa  667    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0170  cysteinyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 478 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 478 aa  354  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 468 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 476 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 457 aa  342  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 458 aa  342  7e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 456 aa  342  9e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 472 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 480 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 485 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 493 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 470 aa  336  5e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 468 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 461 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 500 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 459 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 486 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 475 aa  332  5e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 494 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 459 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 466 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 454 aa  331  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 459 aa  331  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 459 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 459 aa  328  8e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 469 aa  328  8e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 459 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 487 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 462 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 493 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 484 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 479 aa  325  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 485 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 459 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 486 aa  322  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1085  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 491 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189428  normal  0.0293604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 466 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 479 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>