More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0967 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 462 aa  948    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 494 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 460 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 473 aa  382  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 476 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>