More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4569 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008244  Meso_4569  aminotransferase, class V  100 
 
 		 388 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32084  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  47.44 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  47.37 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  44.94 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  45.92 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  46.92 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  45.92 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  44.42 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  43.29 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  47.01 
 
 		 388 aa  319  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  44.92 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  44.92 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  46.81 
 
 		 388 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  47.72 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  44.65 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  44.16 
 
 		 406 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  43.38 
 
 		 405 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.38 
 
 		 405 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  46.44 
 
 		 407 aa  315  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  46.68 
 
 		 406 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  43.12 
 
 		 407 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1841  cysteine sulfinate desulfinase, NifS-like  49.12 
 
 		 384 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  46.03 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  44.12 
 
 		 407 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  44.39 
 
 		 407 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  43.64 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  43.67 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  45.99 
 
 		 404 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  45.45 
 
 		 403 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  44.93 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2373  cysteine desulfurase IscS  45.92 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.934758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 383 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  43.59 
 
 		 404 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  44.16 
 
 		 403 aa  308  8e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  44.44 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  43.53 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  44.74 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  43.93 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  44.44 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  43.58 
 
 		 403 aa  307  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.61 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  44.19 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  45.7 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  44.41 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  43.85 
 
 		 404 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  43.19 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  41.02 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2177  cysteine desulfurase IscS  44.39 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  40.48 
 
 		 422 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2142  cysteine desulfurase IscS  44.74 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2443  cysteine desulfurase IscS  45.28 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  45.21 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  47.61 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  44.65 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  44.1 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  43.85 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  44.15 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  43.59 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 404 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  45.87 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  44.65 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  44.66 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  43.59 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  43.59 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1237  cysteine desulfurase  45.16 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.781022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 404 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  45.33 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  44.95 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  45.33 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 404 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2178  cysteine desulfurase IscS  44.12 
 
 		 405 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000963732  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  43.82 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  42.13 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  42.09 
 
 		 507 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  44.84 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1638  cysteine desulfurase IscS  43.94 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>