46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4097 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  100 
 
 		 189 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  38.51 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  36.57 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  33.91 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  31.52 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  32.46 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  33.73 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  34.1 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  33.91 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  33.51 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  31.75 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  33.33 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  31.98 
 
 		 177 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  31.52 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  34.52 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  27.84 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  29.05 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  38.21 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  35.19 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  28.98 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  24.88 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  28.87 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  31.63 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  31.52 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  32.41 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  31.46 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  41.27 
 
 		 140 aa  48.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  28.98 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  25.84 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  51.06 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  51.06 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  51.06 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  52.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  52.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  52.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  52.94 
 
 		 155 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  52.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  52.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  52.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  45.16 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  51.92 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  26.67 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  26.67 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  36.11 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  47.06 
 
 		 165 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>