74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3442 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  236  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  72.65 
 
 
121 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  72.65 
 
 
121 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  64.41 
 
 
125 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  63.56 
 
 
125 aa  157  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  63.56 
 
 
125 aa  153  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  68.93 
 
 
107 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  60.87 
 
 
121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.01 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  42.24 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  46.55 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  50.57 
 
 
123 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  42.02 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  47.71 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  45.45 
 
 
127 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  45.45 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  44.92 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  45 
 
 
146 aa  87.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  45.37 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  44.44 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  45.37 
 
 
136 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  44.07 
 
 
123 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  46.15 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  47.62 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  37.07 
 
 
119 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  36.21 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  34.82 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  33.62 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  28.7 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  26.5 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  31.86 
 
 
181 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  31.36 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  29.09 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  28.57 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  31.65 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  31.03 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  27.47 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  34.15 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  26.67 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  25 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  26.67 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  29.58 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  32.31 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  26.67 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  26.67 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  28.12 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1338  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  25.27 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  30.21 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  31.88 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  31.88 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  23.08 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  32.84 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  32.88 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>