86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0652 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  85.85 
 
 
107 aa  186  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  66.34 
 
 
105 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  64.42 
 
 
105 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  63.46 
 
 
105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  49.02 
 
 
104 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  48.04 
 
 
104 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  50.5 
 
 
104 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  49.5 
 
 
104 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0633  hypothetical protein  34.78 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  35.23 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  30.93 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  37.63 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  37.23 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  43.55 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  32.32 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  32.32 
 
 
107 aa  53.9  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  33 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  30.53 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  44.44 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  31.96 
 
 
106 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  40.23 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  43.28 
 
 
146 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  41.94 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  41.94 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  41.25 
 
 
104 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  31.63 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  30.93 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  42.62 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  30.93 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  43.55 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  31.63 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  45.16 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  40.32 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  31 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  35.23 
 
 
103 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  36.84 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  37.18 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  28.72 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  31.78 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  38.98 
 
 
126 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  31.88 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  28.7 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  32.17 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  30.97 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  31.51 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  39.34 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  31.51 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  34.33 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  37.31 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  34.33 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  32.88 
 
 
106 aa  42  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  29.36 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  35.82 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  34.25 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  32.56 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  32.56 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  32.56 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  32.56 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  33.78 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  32.84 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  28.77 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  33.78 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  33.78 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  28.77 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  34.25 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  31.51 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  34.33 
 
 
119 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  29.13 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  32.88 
 
 
99 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>