72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2353 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2353  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  100 
 
 
335 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  42.54 
 
 
342 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  35.51 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4572  hypothetical protein  35.62 
 
 
495 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00813276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1368  hypothetical protein  34.8 
 
 
486 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  32.99 
 
 
522 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2950  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase  33.33 
 
 
391 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000917196  normal  0.689261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  33.24 
 
 
496 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0359  hypothetical protein  33.54 
 
 
487 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.296452  normal  0.0315828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  31.61 
 
 
507 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1932  hypothetical protein  31.1 
 
 
518 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0230474  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  34.36 
 
 
541 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  32.43 
 
 
566 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0011  hypothetical protein  32.57 
 
 
484 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2401  hypothetical protein  30.48 
 
 
528 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2306  hypothetical protein  30.99 
 
 
588 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.816445  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  30.59 
 
 
538 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  29.18 
 
 
551 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0471  hypothetical protein  30.51 
 
 
544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.565409  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0104  hypothetical protein  25.33 
 
 
600 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0038  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  24.53 
 
 
590 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000866534 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0061  phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein  27.97 
 
 
310 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1110  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.11 
 
 
392 aa  99  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00714375  hitchhiker  0.00000984633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5743  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.41 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.613269  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.63 
 
 
803 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.92017 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5041  hypothetical protein  30.69 
 
 
632 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0110707  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0021  hypothetical protein  27.18 
 
 
663 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6782  hypothetical protein  28.17 
 
 
600 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0703339  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1053  hypothetical protein  29.47 
 
 
574 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0944363  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4980  hypothetical protein  25.69 
 
 
604 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.519167  hitchhiker  0.00845932 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4362  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.52 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178305  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2713  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.72 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5337  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.02 
 
 
608 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0127085  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4327  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.91 
 
 
612 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0022  hypothetical protein  21.31 
 
 
388 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0523508  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  26.28 
 
 
588 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  26.7 
 
 
509 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0317  hypothetical protein  24.61 
 
 
607 aa  63.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4334  hypothetical protein  25.54 
 
 
598 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  26.47 
 
 
592 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0129  hypothetical protein  23.89 
 
 
817 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  24.21 
 
 
441 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  25.82 
 
 
502 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6014  3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate sulfotransferase (PAPS reductase)/FAD synthetase  24.81 
 
 
597 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.605416  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6191  hypothetical protein  24.63 
 
 
597 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  24.73 
 
 
512 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  25.35 
 
 
594 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  23.96 
 
 
491 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  26.06 
 
 
594 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.18 
 
 
580 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  26.23 
 
 
503 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.37 
 
 
723 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  25.52 
 
 
667 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  25.5 
 
 
428 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  24.06 
 
 
634 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.47 
 
 
421 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  24.46 
 
 
633 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  26.97 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 
469 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  27.07 
 
 
472 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  24.57 
 
 
428 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  25.55 
 
 
464 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0637  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.85 
 
 
270 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.899373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4046  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.41 
 
 
368 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467766  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26 
 
 
784 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  26.95 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  23.31 
 
 
614 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  25 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1211  putative phage-related protein  26.32 
 
 
280 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  25.65 
 
 
796 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.32 
 
 
878 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  30.83 
 
 
880 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>