56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1601 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
147 aa  300  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4256  alkylhydroperoxidase  52.59 
 
 
183 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875283  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.71 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2010  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.94 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1924  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.23 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4347  alkylhydroperoxidase AhpD  43.9 
 
 
169 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3862  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.23 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  34.62 
 
 
145 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.35 
 
 
150 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  30.58 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  33.8 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  35.29 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.53 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  37.1 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05040  carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.11 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  21.7 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1313  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  43.1 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  48.94 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.42 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2606  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.23 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  46 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  29.89 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.48 
 
 
178 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  28.72 
 
 
181 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.64 
 
 
137 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.96 
 
 
182 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  31.08 
 
 
149 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.66 
 
 
111 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.03 
 
 
225 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
114 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.81 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.67 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.36 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.72 
 
 
183 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3172  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.63 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0806  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
114 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
114 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>