19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0806 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0806  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 174 aa  356  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1177  alkylhydroperoxidase  81.33 
 
 		 169 aa  280  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.135888 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0217  hypothetical protein  46.15 
 
 		 164 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0153  hypothetical protein  45.51 
 
 		 183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_162  hypothetical protein  45.51 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0404  alkylhydroperoxidase-like protein  38.56 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00830892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1280  alkylhydroperoxidase  42.98 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000780472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  47.83 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 		 183 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 137 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  29.27 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  37.78 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1601  alkylhydroperoxidase  33.73 
 
 		 147 aa  41.2  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.671034  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  31.71 
 
 		 118 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.65 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>