16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1177 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1177  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.135888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0806  alkylhydroperoxidase  81.33 
 
 		 174 aa  280  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0217  hypothetical protein  45.73 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0153  hypothetical protein  46.84 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_162  hypothetical protein  47.13 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1280  alkylhydroperoxidase  42.28 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000780472  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0404  alkylhydroperoxidase-like protein  36.18 
 
 		 200 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00830892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  31.19 
 
 		 143 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  30 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  38.64 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.86 
 
 		 186 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.86 
 
 		 186 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  43.9 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0600  alkylhydroperoxidase  38.18 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>