More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1006 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  71.57 
 
 		 119 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  69.61 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  69.61 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  72.73 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  70.41 
 
 		 109 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  69.7 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  64.65 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  60.19 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  66.22 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  66.22 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  66.22 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  66.22 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  64.86 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  67.61 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  51.22 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  48.04 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  53.66 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  52.44 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  54.79 
 
 		 87 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  52.44 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  52.63 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  52.44 
 
 		 109 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  46.91 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  50.79 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  50.63 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  51.39 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.83 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.97 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  47.83 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  47.83 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  45.59 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  49.23 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  46.77 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  51.47 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  45.59 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 		 85 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  53.12 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  46.38 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  52.38 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  37.5 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  42.86 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  49.28 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0704  protein of unknown function DUF37  43.84 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000876535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  47.62 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  49.28 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  48.39 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  52.46 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  43.42 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  45.59 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  49.21 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04611  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0406  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  43.42 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  46.03 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04301  hypothetical protein  49.21 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  42.65 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  43.04 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  42.03 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  39.24 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  45.9 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  44.62 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50.82 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  43.06 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50.82 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  46.97 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  46.77 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04721  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.132179  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  39.24 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  41.77 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  47.54 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2522  protein of unknown function DUF37  41.27 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.282944  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  45.83 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  41.03 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  46.58 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  48.39 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  44.44 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  43.48 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  49.18 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  39.24 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  39.24 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  42.47 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  41.18 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2741  hypothetical protein  41.94 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  43.06 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>