37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1376 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  647    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  53.12 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  48.88 
 
 		 322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  49.23 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  48.01 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  45.54 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  41.5 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  43.1 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  37.32 
 
 		 365 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  37.46 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  35.45 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  38.48 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  38.6 
 
 		 329 aa  180  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  35.92 
 
 		 295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  32.04 
 
 		 774 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2087  Protein of unknown function DUF1616  36.97 
 
 		 170 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0413  hypothetical protein  34.08 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00772852  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0595  hypothetical protein  33.99 
 
 		 181 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1358  hypothetical protein  35.06 
 
 		 181 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000188149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  25.34 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  32.49 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  25.61 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2508  Protein of unknown function DUF1616  27.01 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  29.33 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  30.71 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  31.43 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  25.23 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  27.13 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  29.89 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  32.07 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  44 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0472  Protein of unknown function DUF1616  27.12 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  56.14 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0602  hypothetical protein  32.37 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1319  hypothetical protein  26.47 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1083  hypothetical protein  34.34 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.550184  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1285  Protein of unknown function DUF1616  39.34 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>