More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2433 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2433  hydrolase  100 
 
 
268 aa  549  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0256  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  66.29 
 
 
274 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.327339  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2066  hydrolase  58.96 
 
 
280 aa  330  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2312  haloacid dehalogenase-like hydrolase  54.1 
 
 
271 aa  301  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0556  hypothetical protein  50.75 
 
 
274 aa  275  6e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0176824 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1901  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.02 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0708  potassium/copper-transporting ATPase  36.51 
 
 
266 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281693  normal  0.585181 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0375  hydrolase  35.91 
 
 
265 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0946  hydrolase  31.6 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.696714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1767  adenosinetriphosphatase  27.78 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1030  hydrolase  28.15 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0914  hydrolase  28.15 
 
 
263 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.562334  normal  0.776426 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
890 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13063  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal transporting P-type ATPase-like protein  40.96 
 
 
763 aa  66.6  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
755 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.24 
 
 
798 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  42.53 
 
 
779 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  41.77 
 
 
885 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  26.86 
 
 
815 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 
938 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
797 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.76 
 
 
697 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
697 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
697 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
699 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 
789 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0193  copper-transporting P-type ATPase  36.14 
 
 
709 aa  60.5  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0946171  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
744 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
806 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
837 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
706 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
799 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
836 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
720 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
743 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
792 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  37.21 
 
 
696 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
725 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23450  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
647 aa  59.3  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.27443  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
846 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
838 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
762 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0451  heavy metal-transporting ATPase family protein  35.29 
 
 
673 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.390331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
723 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
795 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  35.59 
 
 
752 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
813 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1230  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
743 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.172015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
817 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
811 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
697 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
796 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
817 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
740 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
707 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  43.37 
 
 
754 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  32.56 
 
 
723 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2686  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
656 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682129  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
814 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
819 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
670 aa  57  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
790 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  41.67 
 
 
691 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
752 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
715 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.82 
 
 
833 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  44 
 
 
751 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
762 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.573666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
744 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
795 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
796 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
810 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
798 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5325  Copper-exporting ATPase  37.04 
 
 
823 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2001  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
829 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.790447  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
740 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
818 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
645 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
857 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
793 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
798 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  29.96 
 
 
799 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.02 
 
 
821 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  34.94 
 
 
645 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1548  copper-translocating P-type ATPase  40.48 
 
 
813 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0486383 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
835 aa  56.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
761 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
793 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
761 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
739 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  27.22 
 
 
760 aa  56.6  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
946 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
744 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1792  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
722 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0266735  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40 
 
 
792 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
790 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
702 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
814 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
834 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
637 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>