More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2312 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2312  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
271 aa  556  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2066  hydrolase  54.85 
 
 
280 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2433  hydrolase  54.1 
 
 
268 aa  301  5.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0256  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.68 
 
 
274 aa  301  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.327339  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0556  hypothetical protein  51.13 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0176824 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0708  potassium/copper-transporting ATPase  36.9 
 
 
266 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281693  normal  0.585181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1901  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.64 
 
 
266 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0375  hydrolase  34.87 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0946  hydrolase  30.88 
 
 
276 aa  113  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.696714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1030  hydrolase  27.68 
 
 
263 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1767  adenosinetriphosphatase  27.68 
 
 
263 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0914  hydrolase  27.68 
 
 
263 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.562334  normal  0.776426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
779 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
846 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  42.35 
 
 
799 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
738 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
885 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
815 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  41.38 
 
 
752 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
890 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  35.79 
 
 
1211 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0193  copper-transporting P-type ATPase  36.14 
 
 
709 aa  60.5  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0946171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 
808 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
813 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
792 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
731 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
740 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.71 
 
 
814 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  34.53 
 
 
1040 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1548  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
813 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0486383 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
811 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
731 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
758 aa  59.3  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
814 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
814 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
741 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
758 aa  58.9  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
1021 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
946 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
1021 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
715 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
757 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
819 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
782 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0451  heavy metal-transporting ATPase family protein  37.93 
 
 
673 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.390331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
835 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
790 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  34.12 
 
 
761 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
782 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13063  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal transporting P-type ATPase-like protein  38.55 
 
 
763 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
817 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
706 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
732 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
813 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
755 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 
819 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
754 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
799 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
937 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  25.27 
 
 
798 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
790 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  33.81 
 
 
1013 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  30.57 
 
 
826 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
806 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
744 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
837 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0919  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
697 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
799 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
795 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0943  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
670 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000294219  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  44.71 
 
 
702 aa  55.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
872 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
744 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
707 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  30.89 
 
 
730 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  30.89 
 
 
730 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  39.29 
 
 
792 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
744 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
796 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
752 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
804 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  37.65 
 
 
748 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
806 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
800 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
789 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
697 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
792 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
761 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.04 
 
 
861 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5319  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.55 
 
 
697 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757276  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
753 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1813  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 
800 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  35.23 
 
 
743 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.35 
 
 
795 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
795 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
818 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5408  copper-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
697 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681364  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  30.51 
 
 
1195 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4464  copper-translocating P-type ATPase  38.82 
 
 
710 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991261  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
817 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>