255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2261 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
222 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  89.64 
 
 
225 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  76.02 
 
 
222 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  62.61 
 
 
222 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  55.71 
 
 
222 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  50.23 
 
 
220 aa  240  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  46.58 
 
 
223 aa  218  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  43.44 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  43.44 
 
 
220 aa  194  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  43.44 
 
 
221 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  39.65 
 
 
224 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.18 
 
 
224 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  35.78 
 
 
220 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
220 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  36.53 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  36.02 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  38.26 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.17 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  38.41 
 
 
192 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
193 aa  87  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3016  iron-sulfur flavoprotein  48.28 
 
 
93 aa  85.9  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.718636  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  42 
 
 
193 aa  84.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
193 aa  84.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  40.57 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  39.32 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  40.97 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  33 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  39.68 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  33.72 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  44 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  35.14 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
190 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  28.51 
 
 
262 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  31.66 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  34.33 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  40.4 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  38.68 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  40.82 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.4 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  36.79 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  41.84 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  33.1 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  35.85 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  31.16 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  31.94 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  32.97 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  33.6 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  34.27 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  36.69 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  28.5 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  35.85 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0325  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 
188 aa  72  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  33.02 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  33.81 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  31.69 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  32 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1392  NADPH-dependent FMN reductase  39.8 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.24 
 
 
540 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0672  NADPH-dependent FMN reductase  33.04 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  28.63 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  31.58 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  40 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  28.65 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  33.09 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  32.32 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  33.09 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  33.14 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  38.83 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  32.87 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  31.43 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.96 
 
 
562 aa  68.9  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  38.61 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0909  NADPH-dependent FMN reductase  27.87 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0780942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>