76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3016 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3016  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 		 93 aa  189  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.718636  normal  0.0259997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  47.78 
 
 		 225 aa  90.5  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  48.28 
 
 		 220 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  48.28 
 
 		 222 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  47.13 
 
 		 222 aa  84.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3305  iron-sulfur flavoprotein  45.98 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.328284  normal  0.134625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1815  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  40.23 
 
 		 224 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  44.83 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  42.53 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  36.78 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  40.7 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0938  NADPH-dependent FMN reductase  37.78 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  40.66 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  42.53 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  36.78 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  39.08 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  37.66 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3308  NADPH-dependent FMN reductase  36.36 
 
 		 311 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000769762  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  35.63 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  37.04 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  35.71 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  36.84 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  34.52 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  35.63 
 
 		 193 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  34.83 
 
 		 250 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  30.68 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  30.34 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0357  hypothetical protein  26.88 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  29.41 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 		 214 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1266  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 		 562 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  34.83 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  32.18 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  37.08 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.59 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  32.61 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  31.91 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2120  NADPH-dependent FMN reductase  31.08 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0276138  normal  0.10387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  27.91 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  39.34 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0719  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  34.48 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.96421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2463  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000389494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  30.95 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 		 224 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1492  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 		 540 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  30.43 
 
 		 222 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  31.46 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 		 191 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0159  NADPH-dependent FMN reductase  30.38 
 
 		 203 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  29.49 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 		 217 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  31.11 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3523  NADPH-dependent FMN reductase  29.35 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  32.91 
 
 		 205 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  26.97 
 
 		 186 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>