More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1992 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1992  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  865    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162619  normal  0.881095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1158  cysteinyl-tRNA synthetase  81.15 
 
 		 419 aa  726    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2176  cysteinyl-tRNA synthetase  77.09 
 
 		 423 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0170  cysteinyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 478 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 457 aa  345  6e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 468 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 478 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 470 aa  342  9e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 500 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 466 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 456 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 486 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 484 aa  336  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 481 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 456 aa  335  9e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 480 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 460 aa  334  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 460 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 465 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 472 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 459 aa  329  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 481 aa  328  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 459 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 466 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 485 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 455 aa  323  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 476 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 460 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 465 aa  319  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 464 aa  319  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 461 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 462 aa  319  7e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 486 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 461 aa  316  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 499 aa  316  6e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 466 aa  315  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 456 aa  315  8e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 479 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 494 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 483 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 470 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 470 aa  309  5e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 484 aa  309  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>