More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0492 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0492  malate dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  674    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2444  malate dehydrogenase  68.25 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2343  malate dehydrogenase  65.71 
 
 		 317 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2590  malate dehydrogenase  66.35 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.662548  normal  0.725882 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1271  malate dehydrogenase  58.54 
 
 		 319 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.845217  normal  0.680295 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1548  malate dehydrogenase  46.13 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0959  malate dehydrogenase  45.34 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0244  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1669  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0936564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0610  malate dehydrogenase  44.55 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0952  L-lactate dehydrogenase  35.91 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.172568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0930  L-lactate dehydrogenase  36.51 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3505  L-lactate dehydrogenase  36.79 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0137  L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2007  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2028  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1784  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.521865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1763  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00307694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1741  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1923  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1927  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1959  L-lactate dehydrogenase  34.92 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000164106 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0584  L-lactate dehydrogenase  36.66 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.543838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5012  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0813817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4981  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5032  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4762  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4600  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4624  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000281298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5125  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0236  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0479489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1484  L-lactate dehydrogenase  35.53 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5002  L-lactate dehydrogenase  34.6 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1748  malate dehydrogenase  34.29 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.747056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1798  L-lactate dehydrogenase  37.54 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0938319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4713  L-lactate dehydrogenase  34.38 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0165  L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3415  L-lactate dehydrogenase  37.1 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2797  L-lactate dehydrogenase  35.46 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1053  L-lactate dehydrogenase  35.24 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.689779 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0421  L-lactate dehydrogenase  36.54 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000701213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2434  L-lactate dehydrogenase  34.41 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.167349  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1893  L-lactate dehydrogenase  37.74 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1048  malate dehydrogenase  34.52 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.466907  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0345  malate dehydrogenase (NAD)  35.96 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.569498  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0087  L-lactate dehydrogenase  34.39 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.839635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1918  L-lactate dehydrogenase  35.78 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000101641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0489  L-lactate dehydrogenase  33.99 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0206  L-lactate dehydrogenase  35.92 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0912  malate dehydrogenase, NAD-dependent  37.22 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0881394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1121  malate dehydrogenase  34.85 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1361  L-lactate dehydrogenase  34.18 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1951  malate dehydrogenase (NAD)  34.53 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.800681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3978  malate dehydrogenase (NAD)  35.37 
 
 		 315 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23050  malate dehydrogenase (NAD)  41.86 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697126  normal  0.046368 
 
 
-
 
NC_002978  WD1121  malate dehydrogenase  30.35 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1257  L-lactate dehydrogenase  42.32 
 
 		 320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1867  malate dehydrogenase  34.52 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00765461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0624  malate dehydrogenase  33.02 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000517637  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0398  malate dehydrogenase  34.08 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1053  L-lactate dehydrogenase  33.54 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.189313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1746  Lactate/malate dehydrogenase  34.07 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.591048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1826  malate dehydrogenase (NAD)  33.85 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.490371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2255  malate dehydrogenase  34.3 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1273  malate dehydrogenase  34.08 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.570878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0370  malate dehydrogenase (NAD)  35.29 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0237216  normal  0.979126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0382  malate dehydrogenase (NAD)  35.29 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0391  malate dehydrogenase (NAD)  35.29 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4103  malate dehydrogenase  33.98 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1799  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.06 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0832  malate dehydrogenase  33.44 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1564  L-lactate dehydrogenase  35.16 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  hitchhiker  0.00299399 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1065  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000229856  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0338  malate dehydrogenase  31.58 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2352  L-lactate dehydrogenase  36.84 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0365594  normal  0.0145977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21510  Putative membrane-bound L-lactate-quinone oxidoreductase  37.66 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0347  malate dehydrogenase  34.77 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0700  L-lactate dehydrogenase  36.31 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05842  hypothetical protein similar to L-lactate dehydrogenase (Eurofung)  30.09 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1116  L-lactate dehydrogenase  37.89 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0119464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2374  malate dehydrogenase, NAD-dependent  32.91 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4826  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0862  malate dehydrogenase  34.4 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0390301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2485  L-lactate dehydrogenase  33.8 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0241914  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0641  malate dehydrogenase  33.55 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3778  L-lactate dehydrogenase  33.87 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0307  L-lactate dehydrogenase  33.12 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.251867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5140  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0216  L-lactate dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0100  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5106  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4869  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4708  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 401 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1272  malate dehydrogenase (NAD)  32.7 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000869025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4723  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5142  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000108181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5240  L-lactate dehydrogenase  32.59 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1182  malate dehydrogenase  30.48 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3591  L-lactate dehydrogenase  32.27 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.729354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0439  L-lactate dehydrogenase  33.01 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>