More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3700 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  100 
 
 		 134 aa  276  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  88.81 
 
 		 134 aa  245  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  87.31 
 
 		 134 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  93.55 
 
 		 93 aa  180  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  93.55 
 
 		 105 aa  179  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  91.4 
 
 		 93 aa  174  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  94.05 
 
 		 84 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  79.35 
 
 		 77 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  94.2 
 
 		 69 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3240  transposase  89.06 
 
 		 64 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.408915  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  39.67 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  39.67 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  39.67 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  39.67 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  39.67 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  39.67 
 
 		 187 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  35.16 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  35.16 
 
 		 147 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0571  transposase IS200-family protein  32 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  37.19 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3671  transposase IS200-family protein  32.56 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  42 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  37.04 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  33.08 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0074  transposase IS200-family protein  38.98 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.28559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  41 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  41 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  34.43 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  34.43 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  31.11 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  32.26 
 
 		 315 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  36.29 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  30.77 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  34.43 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0483  transposase IS200-family protein  35.2 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000534402  hitchhiker  0.000799973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  31.93 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  31.06 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  34.38 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  34.68 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  36.64 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  31.75 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  33.6 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  32 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  34.68 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  34.19 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  38.17 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  33.06 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  33.87 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  32.8 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  29.85 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  33.08 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  34.35 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  35.94 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  33.6 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  32.81 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  33.59 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  32.81 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  29.69 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  34.35 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  35.88 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0881  transposase  33.06 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0017451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  30.4 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>