More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2257 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 488 aa  989    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.87 
 
 		 530 aa  259  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.02 
 
 		 513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.83 
 
 		 513 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  35.11 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.01 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.4 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2386  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.13 
 
 		 554 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.654629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  37.23 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.81 
 
 		 498 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  35.17 
 
 		 537 aa  232  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  31.39 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  31.01 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  29.14 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  33.68 
 
 		 543 aa  177  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.71 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  29.96 
 
 		 562 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  29.86 
 
 		 554 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  31.58 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  31.67 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  31.69 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.82 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  30.93 
 
 		 553 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  29.13 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  29.26 
 
 		 571 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  31.4 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  30.72 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  30.43 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  31.63 
 
 		 563 aa  170  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  29.84 
 
 		 554 aa  169  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  30.72 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  30.04 
 
 		 554 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.68 
 
 		 528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  31.17 
 
 		 563 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  29.84 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  29.84 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.86 
 
 		 536 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  29.84 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  30.28 
 
 		 554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.36 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  29.36 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  30.43 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  30.43 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  29.55 
 
 		 556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  29.84 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  28.42 
 
 		 558 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  29.36 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  29.36 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  29.36 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  29.36 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  29.36 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  30.49 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  30.59 
 
 		 555 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  28.95 
 
 		 554 aa  163  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  28.95 
 
 		 556 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  29.16 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  29.02 
 
 		 555 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.86 
 
 		 592 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0465  asparagine synthase  30.37 
 
 		 468 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  28.34 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  28.34 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0732  asparagine synthase  35.35 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  28.34 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  28.54 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  28.34 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  29.38 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  28.2 
 
 		 554 aa  157  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1295  asparagine synthase  38.73 
 
 		 334 aa  156  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.322402 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1754  asparagine synthase  33.43 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  30.37 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  29.81 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  28.81 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  28.81 
 
 		 554 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  28.1 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  29.03 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  26.82 
 
 		 596 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  28.07 
 
 		 554 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0961  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.58 
 
 		 630 aa  148  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1015  asparagine synthase  36.92 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  28.66 
 
 		 554 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  28.66 
 
 		 554 aa  147  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  28.66 
 
 		 554 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  29.07 
 
 		 638 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  27.46 
 
 		 554 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0855  asparagine synthase  38.7 
 
 		 334 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.489372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1987  asparagine synthase  32.96 
 
 		 366 aa  143  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.01 
 
 		 606 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.59 
 
 		 588 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0834  hypothetical protein  35.2 
 
 		 319 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4334  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.36 
 
 		 645 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969348  decreased coverage  0.00494377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3539  asparagine synthase  31.87 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0774  asparagine synthase  32.79 
 
 		 332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.780616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.67 
 
 		 676 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.465909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>