More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1611 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  52.49 
 
 
248 aa  234  9e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  46.29 
 
 
227 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  46.95 
 
 
207 aa  187  8e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0961  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.99 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.233776  hitchhiker  0.000990289 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0391  ABC transporter related  40.71 
 
 
257 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.578216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  42.79 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 
320 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
708 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
703 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1249  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.94 
 
 
320 aa  176  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
443 aa  174  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  44.28 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.772702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2381  ABC transporter related  42.13 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0184159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  40.09 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.37 
 
 
423 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08340  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.5 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.571186  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  41.89 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
335 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
339 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  44.79 
 
 
617 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1565  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.67 
 
 
335 aa  171  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000744963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
311 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  39.57 
 
 
254 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
444 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 
609 aa  171  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 
674 aa  170  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  42 
 
 
551 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4733  ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
262 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.497706  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 
389 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0475544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
311 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
311 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
311 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
311 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
311 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
311 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  40 
 
 
282 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.8 
 
 
326 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  42.35 
 
 
308 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 
338 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0468  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 
327 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.418458  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  39.3 
 
 
555 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 
230 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 
235 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 
465 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  43.41 
 
 
575 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
311 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.13 
 
 
478 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 
311 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  42.56 
 
 
308 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1594  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.52 
 
 
441 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5117  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
279 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  39.38 
 
 
307 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3390  ABC transporter related  46.32 
 
 
268 aa  168  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
292 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1253  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 
347 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1075  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.76 
 
 
319 aa  168  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 
308 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 
308 aa  167  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  40.69 
 
 
329 aa  167  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.536054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 
308 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 
308 aa  167  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 
308 aa  167  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
388 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  41.38 
 
 
311 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  40.59 
 
 
627 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 
391 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000220082  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  45.79 
 
 
268 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6153  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 
342 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.798522  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2470  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 
318 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  40.38 
 
 
674 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  39.3 
 
 
556 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.63 
 
 
327 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 
311 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
339 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0145  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  42.17 
 
 
565 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0227  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  40.09 
 
 
312 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  38.81 
 
 
555 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  37 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.05 
 
 
334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  37.05 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  37 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  37 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3024  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.42 
 
 
346 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  37 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  37.9 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  37 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 
329 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 
551 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 
337 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0756  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
320 aa  165  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.288444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.24 
 
 
690 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
327 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0636  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
322 aa  165  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  36.56 
 
 
268 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  37.89 
 
 
505 aa  165  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1928  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  39.44 
 
 
311 aa  165  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.8 
 
 
665 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>