More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0708 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0708  potassium/copper-transporting ATPase  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281693  normal  0.585181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1901  haloacid dehalogenase-like hydrolase  54.96 
 
 
266 aa  289  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0256  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.6 
 
 
274 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.327339  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2066  hydrolase  36.23 
 
 
280 aa  172  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2312  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.64 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2433  hydrolase  35.85 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0375  hydrolase  36.5 
 
 
265 aa  155  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0556  hypothetical protein  35.85 
 
 
274 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0176824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0914  hydrolase  33.21 
 
 
263 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.562334  normal  0.776426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1767  adenosinetriphosphatase  32.06 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1030  hydrolase  32.82 
 
 
263 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0946  hydrolase  31.94 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.696714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  30.69 
 
 
885 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
890 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  34.04 
 
 
798 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
821 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
723 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2543  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  32.31 
 
 
915 aa  52.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  33.02 
 
 
1182 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0502  cation-transporting ATPase, E1-E2 type  32.22 
 
 
880 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.61983 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13063  P-ATPase family transporter: copper ion; heavy metal transporting P-type ATPase-like protein  33.33 
 
 
763 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45970  putative cation-transporting P-type ATPase  29.66 
 
 
902 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3900  cation-transporting ATPase Pma1  29.66 
 
 
902 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0969294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0197  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  29.37 
 
 
888 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.846204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0451  heavy metal-transporting ATPase family protein  31.3 
 
 
673 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.390331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1621  copper-translocating P-type ATPase  27.73 
 
 
761 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.996333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 
806 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 
789 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4898  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  31.43 
 
 
947 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918596  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0649  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  33.65 
 
 
873 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01591  putative P-type ATPase transporter for copper  36.14 
 
 
765 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.443919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0705  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
779 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5730  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  34.38 
 
 
1032 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0095  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.72 
 
 
884 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.668682  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  33.96 
 
 
724 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.9 
 
 
739 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4629  copper-translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
702 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4241  copper-translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
720 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1923  ATPase, E1-E2 type  36.59 
 
 
898 aa  49.3  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2598  copper-translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
725 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
715 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  30.89 
 
 
1195 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3293  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  33.66 
 
 
889 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.954514 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0136  copper-translocating P-type ATPase  28.97 
 
 
770 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0727  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
792 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000426608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
796 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64379  calcium/mangenease P-type ATPase  30.23 
 
 
923 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00018171  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2772  copper-translocating P-type ATPase  31.91 
 
 
757 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  30.85 
 
 
822 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.67 
 
 
751 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0499  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  32.03 
 
 
1441 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3886  copper-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
705 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  33.02 
 
 
1055 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 
758 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0915  copper-translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
706 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  34.91 
 
 
797 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  32.48 
 
 
647 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3055  copper-translocating P-type ATPase  32.2 
 
 
777 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  27.13 
 
 
790 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2136  magnesium-transporting ATPase MgtA  41.18 
 
 
919 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2998  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  36.9 
 
 
590 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0585591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
730 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
795 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  23.93 
 
 
1196 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1763  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 
720 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  29.1 
 
 
641 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0349  ATPase, E1-E2 type  31.85 
 
 
1521 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1268  ATPase, E1-E2 type  33.71 
 
 
913 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.652598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2992  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  31.37 
 
 
964 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1869  copper-translocating P-type ATPase  33.73 
 
 
741 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0327239 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 
744 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2852  copper-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
707 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.738048 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  29.79 
 
 
781 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  29.79 
 
 
781 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
639 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31400  copper/silver-translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
697 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0193  copper-transporting P-type ATPase  28.18 
 
 
709 aa  47  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0946171  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
795 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  35.63 
 
 
796 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  29.1 
 
 
641 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.79 
 
 
798 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.79 
 
 
798 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.68 
 
 
817 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
767 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0133  putative P-type ATPase transporter for copper  28.79 
 
 
768 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.57861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1166  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  32.65 
 
 
342 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4479  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  29.37 
 
 
940 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  32.69 
 
 
641 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  32.69 
 
 
641 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  32.69 
 
 
641 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  32.69 
 
 
641 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  32.69 
 
 
641 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5698  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
697 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113877  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  32.69 
 
 
641 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  32.69 
 
 
641 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1665  ATPase, E1-E2 type  28.97 
 
 
889 aa  46.2  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1082  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  37.18 
 
 
897 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4033  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  24.34 
 
 
698 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 
739 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0682  heavy metal translocating P-type ATPase  29.66 
 
 
741 aa  45.8  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0741733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>