71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1180 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  74.19 
 
 		 223 aa  338  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  72.22 
 
 		 218 aa  335  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  70.51 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  70.05 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  70.05 
 
 		 221 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  70.05 
 
 		 221 aa  320  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  69.3 
 
 		 222 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  68.37 
 
 		 218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  70.56 
 
 		 214 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  69.16 
 
 		 214 aa  308  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  64.32 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  58.18 
 
 		 223 aa  251  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  58.8 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  56.54 
 
 		 220 aa  246  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  57.21 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  52.05 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  49.08 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  46.64 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  46.64 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.58 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  45.12 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.05 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.89 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.16 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.19 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  41.98 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.89 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.99 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.19 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.67 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  42.33 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0869  anti-sigm factor, ChrR  42.59 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.09 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.5 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.56 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0840  anti-sigma factor, ChrR  40.72 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1946  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.36 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00378013  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  38.57 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  44.02 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  34.76 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1968  anti-Sigm factor, ChrR  43.97 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  49.23 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  49.23 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  44.62 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  32.35 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3257  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.98 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442246  normal  0.111032 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6860  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.27 
 
 		 136 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2472  anti-sigm factor, ChrR  43.33 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.483016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  34.34 
 
 		 116 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.5 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1050  hypothetical protein  36.08 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.94 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.36 
 
 		 125 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.66 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4022  anti-sigm factor, ChrR  27.96 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4208  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  32.91 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  31.37 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  31.37 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4237  anti-ECFsigma factor, ChrR  26.97 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0635391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2409  hypothetical protein  31.37 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0376  hypothetical protein  34.29 
 
 		 126 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  31.37 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  32.98 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.05 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  32.22 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6312  hypothetical protein  31 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>