52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1016 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  100 
 
 
293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 
281 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  30.91 
 
 
290 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  29.63 
 
 
284 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  29.67 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  29.71 
 
 
273 aa  89  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  31.61 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  30.59 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  33.18 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  34.67 
 
 
159 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  35.25 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.88 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  28.03 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  28.03 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.32 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  27.35 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  32.08 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  32.08 
 
 
151 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.43 
 
 
158 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  28.3 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  28.3 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  28.3 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  28.3 
 
 
155 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  28.3 
 
 
155 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  29.71 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.54 
 
 
154 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  28.3 
 
 
155 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  33.94 
 
 
158 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  28.3 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  33.12 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  25.95 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.05 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  25.48 
 
 
151 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.41 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 
146 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  29.11 
 
 
155 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.67 
 
 
138 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 
188 aa  43.5  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  28.66 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  30.07 
 
 
168 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
163 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.87 
 
 
145 aa  43.1  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.31 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 
167 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.3 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 
139 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
163 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  25 
 
 
145 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.77 
 
 
145 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>