110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1390 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  71.88 
 
 		 71 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  70.31 
 
 		 71 aa  95.5  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  71.88 
 
 		 71 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  70.31 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  56.92 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  52.38 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  42.19 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  41.54 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  47.46 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  38.46 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  42.62 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.92 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  37.1 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  35.48 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  35.48 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  31.75 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1859  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 74 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0881422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 68 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  32.26 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  32.26 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  35 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 68 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  30.65 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  30.65 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  30.65 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  32.26 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  32.79 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  36.67 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  31.15 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>