89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0910 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0910  chorismate mutase  100 
 
 
98 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.841588  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1451  chorismate mutase  46.59 
 
 
100 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0315  chorismate mutase  46.67 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1599  chorismate mutase  47.25 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1029  chorismate mutase  47.06 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.809683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  34.07 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2349  Chorismate mutase  33.7 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0301924  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5134  chorismate mutase  34.52 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  32.95 
 
 
346 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  33.33 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  30.49 
 
 
456 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  33.75 
 
 
108 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  32.93 
 
 
372 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  27.16 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0235  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.07 
 
 
391 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1988  Chorismate mutase  31.71 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.71 
 
 
384 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.92 
 
 
358 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.92 
 
 
358 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3146  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.25 
 
 
386 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.831222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  30.49 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0727  chorismate mutase  26.32 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  29.76 
 
 
386 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1133  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  31.25 
 
 
386 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0661  P-protein (includes: chorismate mutase and prephenate dehydratase)  28.89 
 
 
391 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.33 
 
 
358 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  28.21 
 
 
399 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  28.4 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0155  chorismate mutase  26.37 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  28.4 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 
360 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02452  hypothetical protein  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.699641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02488  fused chorismate mutase P/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.610433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1084  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165593  hitchhiker  0.00000412255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2751  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000608431  normal  0.0711319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2986  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000154451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1075  chorismate mutase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3838  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000574807  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2883  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0920297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  29.87 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2756  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
386 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  8.8068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0876  chorismate mutase  30.68 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0999  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  30 
 
 
393 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
375 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  40 
 
 
362 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  40 
 
 
360 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.76 
 
 
360 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  29.76 
 
 
360 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  29.17 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  28.77 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  28.21 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3077  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  28.75 
 
 
396 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0866115  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.06 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  31.65 
 
 
333 aa  42.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  38 
 
 
360 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
344 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  27.06 
 
 
375 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.88 
 
 
375 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
373 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  25.64 
 
 
393 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 
381 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
377 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  27.96 
 
 
403 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.36 
 
 
373 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.36 
 
 
373 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.36 
 
 
373 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.36 
 
 
373 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>