More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0813 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0813  DNA-binding protein HU  100 
 
 		 208 aa  387  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.911341  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl670  histone-like DNA-binding protein  43 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0429  histone family protein DNA-binding protein  45.45 
 
 		 92 aa  62  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00929572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0860  histone family protein DNA-binding protein  46.55 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0124999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  44.26 
 
 		 90 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl201  histone-like DNA-binding protein  34.41 
 
 		 90 aa  57  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.25153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  31.52 
 
 		 90 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  31.52 
 
 		 90 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0956  DNA-binding protein HU-alpha  43.1 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4682  histone family protein DNA-binding protein  43.1 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0505442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 1022 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  43.75 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  40 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  38.03 
 
 		 91 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  43.64 
 
 		 90 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_013889  TK90_0576  histone family protein DNA-binding protein  37.31 
 
 		 90 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  36.36 
 
 		 90 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  44 
 
 		 92 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  48.21 
 
 		 91 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  30.43 
 
 		 90 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  35.96 
 
 		 90 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  30.43 
 
 		 90 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004041  DNA-binding protein HU-beta  37.08 
 
 		 90 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000015142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4039  HU family DNA-binding protein  41.38 
 
 		 93 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  47.27 
 
 		 91 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  41.38 
 
 		 90 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4749  histone-like DNA-binding protein  41.38 
 
 		 93 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  41.82 
 
 		 90 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  35.48 
 
 		 91 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  38.98 
 
 		 94 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  38.98 
 
 		 94 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2799  histone family protein DNA-binding protein  38.36 
 
 		 91 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2207  histone family protein DNA-binding protein  34.83 
 
 		 91 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  32.26 
 
 		 98 aa  52.4  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  37.25 
 
 		 1284 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  42.31 
 
 		 90 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0313  DNA-binding protein, HU  39.73 
 
 		 92 aa  52  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.657113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  37.11 
 
 		 110 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2029  histone family protein DNA-binding protein  35.9 
 
 		 95 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1251  histone family protein DNA-binding protein  35.06 
 
 		 91 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0902596  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  43.1 
 
 		 92 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2903  histone family protein DNA-binding protein  35.06 
 
 		 91 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00933352  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  40.58 
 
 		 90 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2521  DNA-binding protein HU-beta  39.66 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0944475  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  32.89 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  32.5 
 
 		 91 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3933  histone family protein DNA-binding protein  41.38 
 
 		 92 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4202  histone family protein DNA-binding protein  34.94 
 
 		 95 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  39.71 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2793  histone family protein DNA-binding protein  39.66 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  39.71 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  39.71 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  32.89 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3398  histone family protein DNA-binding protein  45.1 
 
 		 92 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000223697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1118  HU family DNA-binding protein  43.64 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2824  nucleoid protein Hbs  38.71 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.669113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3356  histone-like DNA-binding protein  33.77 
 
 		 95 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.860208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  38.96 
 
 		 92 aa  51.2  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4504  DNA-binding protein HU-alpha  41.38 
 
 		 92 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2800  histone family protein DNA-binding protein  40.79 
 
 		 91 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0357703  normal  0.314241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  33.33 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2054  histone family protein DNA-binding protein  38.71 
 
 		 91 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00333504  normal  0.0104655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  32.95 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1509  DNA-binding protein HU-beta  35.96 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000490467  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  32.95 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  32.89 
 
 		 90 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2386  histone family protein DNA-binding protein  39.66 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  37.66 
 
 		 90 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1098  histone family protein DNA-binding protein  27.18 
 
 		 101 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00970005  hitchhiker  0.00000236625 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  44.23 
 
 		 90 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0991  DNA-binding protein HU  44.64 
 
 		 98 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  0.0000336504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  37.66 
 
 		 90 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  36.9 
 
 		 90 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  31.82 
 
 		 90 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0181  histone family protein DNA-binding protein  27.96 
 
 		 95 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  43.08 
 
 		 90 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5039  histone family protein DNA-binding protein  36.07 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  31.82 
 
 		 90 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3362  histone family protein DNA-binding protein  32.86 
 
 		 102 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.936613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3397  DNA-binding protein HU, form B  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.218557  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  42.31 
 
 		 90 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0004  DNA-binding protein HU-alpha  43.4 
 
 		 92 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4266  histone family protein DNA-binding protein  31.46 
 
 		 93 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>