More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0538 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0538  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  100 
 
 		 623 aa  1259    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.033802  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl534  multidrug/protein/lipid ABC transporter ATP-binding component  52.24 
 
 		 659 aa  630  1e-179  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.483013  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl423  multidrug ABC transporter  46.53 
 
 		 614 aa  495  9.999999999999999e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00524673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl422  multidrug ABC transporter  44.74 
 
 		 610 aa  489  1e-137  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0537  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  45.02 
 
 		 617 aa  437  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.68995  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl533  multidrug ABC transporter  39.68 
 
 		 635 aa  393  1e-108  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  36.56 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 		 566 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  34.78 
 
 		 566 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.76 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.58 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.64 
 
 		 571 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.46 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.46 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.46 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.54 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.72 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.96 
 
 		 572 aa  273  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  32.89 
 
 		 586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  31.95 
 
 		 576 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  31.47 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  31.47 
 
 		 572 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.44 
 
 		 575 aa  266  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  31.46 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.46 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.29 
 
 		 572 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  35.09 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.89 
 
 		 578 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.58 
 
 		 556 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.27 
 
 		 586 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 		 586 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.4 
 
 		 586 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.08 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.32 
 
 		 636 aa  259  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.08 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  31.57 
 
 		 612 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.3 
 
 		 601 aa  258  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  36.81 
 
 		 468 aa  258  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.7 
 
 		 578 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.7 
 
 		 578 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.86 
 
 		 584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.21 
 
 		 580 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.95 
 
 		 584 aa  253  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  31.41 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  31.49 
 
 		 615 aa  251  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  28.67 
 
 		 582 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.67 
 
 		 608 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  31.84 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  30.49 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  30.08 
 
 		 645 aa  248  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  29.74 
 
 		 628 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  31.28 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  30.2 
 
 		 585 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  31.1 
 
 		 582 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.74 
 
 		 586 aa  247  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  31.49 
 
 		 546 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.69 
 
 		 589 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  31.15 
 
 		 597 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.84 
 
 		 618 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  32.01 
 
 		 618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.83 
 
 		 625 aa  244  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  30.1 
 
 		 627 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.86 
 
 		 594 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.96 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  29.03 
 
 		 568 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  32.73 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf684  ABC-type multidrug transport system  31.13 
 
 		 617 aa  242  2e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  31.23 
 
 		 578 aa  242  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  31.67 
 
 		 625 aa  242  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.87 
 
 		 587 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.7 
 
 		 632 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  33.6 
 
 		 575 aa  240  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  32.19 
 
 		 586 aa  240  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  31.6 
 
 		 626 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  29.69 
 
 		 566 aa  240  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  31.85 
 
 		 603 aa  239  9e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  31.58 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  34.13 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.52 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.85 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  30.19 
 
 		 636 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  30.59 
 
 		 594 aa  238  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  30.38 
 
 		 567 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.38 
 
 		 567 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  29.12 
 
 		 660 aa  237  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  31.24 
 
 		 600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  30.64 
 
 		 613 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  30.23 
 
 		 676 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  29.27 
 
 		 601 aa  236  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>