More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0009 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0009  DNA repair protein RecM  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.35386  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl677  recombination protein  57.73 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  37.82 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  36.79 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  38.97 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 198 aa  141  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  35.75 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  35.75 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  35.9 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  34.34 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  35.38 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  35.78 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  31.77 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  35.23 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  33.33 
 
 		 199 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  38.97 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  31.47 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  35.11 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  35.11 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  32.83 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2895  recombination protein RecR  32.04 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  38.97 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  32.99 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  32.47 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  35.98 
 
 		 201 aa  135  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  33.33 
 
 		 198 aa  135  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  34.87 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  32.31 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  33.5 
 
 		 199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  32.14 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  34.18 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  32.14 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  32.14 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  34.87 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  33.16 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  32.65 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  31.79 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10891  RecR protein  38.76 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.683026  normal  0.323303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1611  recombination protein RecR  35.71 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  31.63 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  33.16 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  31.63 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  35.39 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  33.51 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1600  recombination protein RecR  35.68 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  31.63 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  36.11 
 
 		 198 aa  130  9e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  31.5 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  35.83 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  35.79 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  32.31 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  31.79 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4008  recombination protein RecR  30.88 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  35.57 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0367  recombination protein RecR  33.68 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000104569  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  32.31 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4846  recombination protein RecR  33.15 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.816278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  30.26 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  30.73 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  35.23 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  31.79 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  31.79 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1853  recombination protein RecR  30.21 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.38333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  32.31 
 
 		 202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0666  recombination protein RecR  34.81 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.290354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1326  recombination protein RecR  32.63 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.787155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  35.08 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  35.23 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0437  DNA replication and repair protein RecR  36.52 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.792606  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1288  recombination protein RecR  29.8 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5271  recombination protein RecR  28.79 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4992  recombination protein RecR  28.79 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4903  recombination protein RecR  28.79 
 
 		 203 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  33.51 
 
 		 204 aa  127  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  33.68 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5527  recombination protein RecR  29.8 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0621  recombination protein RecR  34.25 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0085  recombination protein RecR  34.25 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344272  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  33.51 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  31.63 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  32.99 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2777  recombination protein RecR  32.83 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  27.84 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1998  recombination protein RecR  32.54 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1409  recombination protein RecR  33.16 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.468928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1325  recombination protein RecR  31.58 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.265741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  31.58 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1460  recombination protein RecR  29.08 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0464  recombination protein RecR  31.63 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>