33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf660 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  100 
 
 		 487 aa  992    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  38.28 
 
 		 194 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  35.65 
 
 		 206 aa  128  3e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  33.81 
 
 		 206 aa  122  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  34.62 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  33.65 
 
 		 221 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  34.27 
 
 		 201 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  33.18 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  33.8 
 
 		 201 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  32.69 
 
 		 201 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  32.72 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  35.33 
 
 		 220 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  31.51 
 
 		 209 aa  89  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  30.05 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  31.54 
 
 		 754 aa  73.6  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  26.83 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  37.21 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  25.94 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  26.07 
 
 		 241 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  30.59 
 
 		 215 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  53.49 
 
 		 321 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  31.58 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1045  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.964282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  46.67 
 
 		 251 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  30.53 
 
 		 691 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  46.51 
 
 		 216 aa  51.2  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  45.65 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  48.89 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  25.69 
 
 		 215 aa  47  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  38.3 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  25.56 
 
 		 152 aa  43.9  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  27.38 
 
 		 209 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1276  hypothetical protein  27.97 
 
 		 361 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>