More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf179 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf179  recombinase A  100 
 
 		 334 aa  670    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  57.85 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  56 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  55.56 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  55.83 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  54.24 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  56.83 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  55.21 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  55.42 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  53.85 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  54.94 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  53.94 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  55.42 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  53.85 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  55.25 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  55.02 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  54.01 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  54.32 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  54.63 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  54.94 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  54.63 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  54.24 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  55.24 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  53.92 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  53.35 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  53.94 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  54.71 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  54.94 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  53.4 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  54.32 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  53.94 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  53.94 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  52.42 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  53.09 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  53.44 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  52.8 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  54.38 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  52.58 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  53.99 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  53.7 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  53.13 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  51.65 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  55.11 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  52.94 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  54.78 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  53.27 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  53.33 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  53.8 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  53.75 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  52.76 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  54.77 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  53.7 
 
 		 374 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  54.72 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  54.09 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  55.05 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  51.82 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  53.7 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  52.74 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  54.09 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  56.45 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  56.62 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  52.89 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  53.4 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  56.6 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  55.15 
 
 		 379 aa  371  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  52.78 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  54.72 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  52.34 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  57.28 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  52.89 
 
 		 348 aa  371  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  54.55 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  53.87 
 
 		 352 aa  371  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  53.44 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  53.27 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  53.56 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  54.86 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  57.05 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  54.85 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  55.14 
 
 		 349 aa  371  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  53.56 
 
 		 367 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  53.14 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  52.81 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  57.73 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  53.63 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  57.41 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  52.47 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  58.88 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  52.81 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  53.31 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  52.81 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  57.73 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  53.12 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  52.81 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  53.99 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  53.77 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  54.35 
 
 		 346 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  60.27 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  52.15 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  54.71 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  54.4 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>