More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03558 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 719 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3981  sensor histidine kinase  47.29 
 
 		 738 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  48.27 
 
 		 687 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 		 722 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 		 722 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03558  putative sensor histidine kinase  100 
 
 		 722 aa  1482    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.87 
 
 		 738 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2519  histidine kinase  48.54 
 
 		 728 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 		 723 aa  711    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  48.54 
 
 		 722 aa  704    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.51 
 
 		 725 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355217  normal  0.132598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.54 
 
 		 722 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.34 
 
 		 750 aa  827    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 		 719 aa  704    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.68 
 
 		 719 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 		 723 aa  703    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  48.68 
 
 		 719 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  48.47 
 
 		 719 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1015  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 690 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 678 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1202  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.868764  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 525 aa  124  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 564 aa  120  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 465 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 577 aa  110  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 574 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  25.17 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  23.91 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 469 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 486 aa  96.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  23.49 
 
 		 469 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  22.73 
 
 		 475 aa  96.3  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 		 489 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 529 aa  95.1  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 540 aa  95.1  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 607 aa  94.7  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 486 aa  94  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  23.83 
 
 		 589 aa  93.6  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 468 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 490 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 		 469 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 502 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  23.59 
 
 		 601 aa  90.9  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.03 
 
 		 592 aa  90.9  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 445 aa  90.5  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 		 488 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.98 
 
 		 615 aa  89.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 470 aa  89  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.62 
 
 		 559 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  25.78 
 
 		 405 aa  87.8  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  22.8 
 
 		 474 aa  87.8  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 		 487 aa  87.8  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.1 
 
 		 581 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  24.01 
 
 		 572 aa  87.4  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  24.01 
 
 		 572 aa  87.4  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  22.95 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  24.75 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  24.2 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 550 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  24.19 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  23.5 
 
 		 607 aa  85.9  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.848093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.34 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  25.42 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.76 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  22 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  23.05 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.02 
 
 		 781 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  24.04 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 		 578 aa  84.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  24.04 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  23.55 
 
 		 476 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 616 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 386 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  23.55 
 
 		 616 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  24.04 
 
 		 467 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  23.55 
 
 		 616 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.82 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  21.6 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  24.23 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 		 605 aa  82.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  23.86 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 611 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  24.52 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  25.32 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.52 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>