More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03484 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03484  quinol oxidase, subunit II  100 
 
 
335 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3838  quinol oxidase, subunit II  51.64 
 
 
332 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1227  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  51.94 
 
 
334 aa  328  7e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0219402  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2689  cytochrome bd-I oxidase subunit II  49.7 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00269242  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1174  quinol oxidase, subunit II  51.38 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03187  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit II) oxidoreductase protein  47.09 
 
 
343 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.337789  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2574  putative quinol oxidase subunit II transmembrane protein  45.96 
 
 
331 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.364197  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4116  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  43.87 
 
 
343 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5233  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  45.4 
 
 
345 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.507916 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4270  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  46.48 
 
 
343 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4158  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  46.48 
 
 
343 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0737  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  45.54 
 
 
337 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0495  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  42.33 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.58 
 
 
338 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.243968  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000388  putative Cytochrome bd2 subunit II  36.8 
 
 
335 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.69 
 
 
334 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0741  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.53 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0192  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.12 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0255  hypothetical protein  38.74 
 
 
329 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4379  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.09 
 
 
334 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3152  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.37 
 
 
335 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1695  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.87 
 
 
338 aa  207  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0476582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3833  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.58 
 
 
336 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1516  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.87 
 
 
338 aa  207  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.900385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4142  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.99 
 
 
336 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4073  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.91 
 
 
336 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.889217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0260  hypothetical protein  37.84 
 
 
329 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5280  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.69 
 
 
334 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4065  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.3 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03150  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit II) oxidoreductase protein  39.51 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73808  normal  0.0133752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2132  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.38 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.19324  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4650  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.85 
 
 
335 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4892  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37 
 
 
335 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4644  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.85 
 
 
335 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39866  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.47 
 
 
336 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.54 
 
 
335 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.31 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0788  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.74 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0675  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.37 
 
 
347 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340894 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2149  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.17 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1786  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2  38.37 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.703016  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0713  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.76 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.53 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.238614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0927  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.23 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.304728  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0702  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.76 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  39.05 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1766  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.13 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3377  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.74 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1178  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.07 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1769  cyanide-insensitive terminal oxidase  37.17 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0427  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  37.17 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13040  CioB, cyanide insensitive terminal oxidase  37.07 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1128  cyanide-insensitive terminal oxidase  37.17 
 
 
335 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.852695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2101  cyanide-insensitive terminal oxidase  37.17 
 
 
335 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1836  cyanide-insensitive terminal oxidase  37.17 
 
 
335 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0837  cyanide-insensitive terminal oxidase  37.17 
 
 
335 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1473  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.61 
 
 
335 aa  195  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3574  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.74 
 
 
335 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0902156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3117  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.44 
 
 
334 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5512  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  42.64 
 
 
337 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.716831  normal  0.432807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02215  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  38.32 
 
 
339 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.97 
 
 
337 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119875  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3271  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.24 
 
 
335 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327803  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0334  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  36.2 
 
 
335 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0929  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.44 
 
 
335 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3450  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.44 
 
 
335 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3385  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.89 
 
 
338 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3332  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.88 
 
 
335 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2643  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.51 
 
 
335 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3592  Cytochrome bd type quinol oxidase subunit 2 protein  37.43 
 
 
334 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4819  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.17 
 
 
335 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5366  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.17 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0942  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.36 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.616376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1086  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.36 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0913  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.26 
 
 
335 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4100  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.92 
 
 
335 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00146207  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3210  quinol oxidase subunit II QxtB  37.39 
 
 
335 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00094  ubiquinol oxidase subunit II, cyanide insensitive  36.83 
 
 
333 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.21 
 
 
335 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3287  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  40.8 
 
 
337 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3951  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  37.98 
 
 
335 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4281  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  38.56 
 
 
335 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.207239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0707  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II (cydB, qxtB)  37.88 
 
 
336 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4647  cyanide-insensitive terminal oxidase CioB  37.54 
 
 
335 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1251  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.95 
 
 
347 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4956  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  38.44 
 
 
335 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.545349  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  37.17 
 
 
335 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5382  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.87 
 
 
335 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5479  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.87 
 
 
335 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779913  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4790  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.87 
 
 
335 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0595  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.55 
 
 
336 aa  185  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal  0.217419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4324  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.83 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.5 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2426  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.64 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154606  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  36.25 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3306  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.87 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.167701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1026  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.42 
 
 
332 aa  183  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2039  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.84 
 
 
341 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1614  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  38.55 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0417  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  39.25 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.227269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>