More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00762 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  81.89 
 
 		 127 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  81.1 
 
 		 127 aa  216  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  77.95 
 
 		 130 aa  214  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  75.59 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  75.59 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  71.65 
 
 		 128 aa  203  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  70.87 
 
 		 130 aa  199  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  68.5 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  70.08 
 
 		 130 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  70.08 
 
 		 130 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  70.87 
 
 		 129 aa  192  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  65.08 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.21 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.71 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  34.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  34.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  35.51 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.65 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  34.92 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  35.51 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  31.5 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.2 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  35.78 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  32.03 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  32.46 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>