88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6436 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  86.13 
 
 		 173 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  67.05 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  66.67 
 
 		 163 aa  210  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  59.43 
 
 		 175 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  60.34 
 
 		 174 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  60.48 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  60.48 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  60.53 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  43.43 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  48.98 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  49.25 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  45.34 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  47.3 
 
 		 183 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  48.2 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  48.2 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  48.2 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  48.2 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  48.2 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  48.92 
 
 		 182 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  48.92 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  40.91 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  27.01 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  35.92 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  26.26 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  32.06 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  31.39 
 
 		 216 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  31.14 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  30.41 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  34.51 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  26.21 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  31.71 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  27.5 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  30.72 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  36 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  30.2 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  31.97 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  29.56 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  29.69 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  29.01 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  34.38 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  30.51 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  32.26 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  29.82 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  29.2 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  30.66 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  27.64 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  33.05 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  27.22 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  28.35 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  29.46 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  33.7 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2744  outer membrane protein  27.27 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  48.72 
 
 		 236 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  48.72 
 
 		 236 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2966  hypothetical protein  33.88 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204675  normal  0.0956768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  48.72 
 
 		 236 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  35.56 
 
 		 230 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  27.92 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  29.79 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0910  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  26.26 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  32.98 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  39.39 
 
 		 233 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  26.28 
 
 		 302 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  32.58 
 
 		 201 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  26.47 
 
 		 318 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  24.65 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  32.06 
 
 		 197 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  29.13 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  31.46 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>