63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3728 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3728  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4659  hypothetical protein  85.38 
 
 		 230 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  62.34 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  62.34 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1527  hypothetical protein  62.34 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178788  normal  0.568134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  58.72 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0750  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3766  hypothetical protein  29.11 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1308  hypothetical protein  42.42 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  36.62 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5233  hypothetical protein  27.86 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0279133  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  39.19 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  36.71 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5308  hypothetical protein  27.69 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.969326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4766  hypothetical protein  27.69 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2979  hypothetical protein  32.88 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.281823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4061  hypothetical protein  27.36 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.507546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3624  hypothetical protein  32.47 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3401  hypothetical protein  35.42 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  60 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4022  hypothetical protein  35.62 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3731  hypothetical protein  32.47 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.352743  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  36.99 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  29.87 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3212  hypothetical protein  29.87 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  38.03 
 
 		 173 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5287  hypothetical protein  51.06 
 
 		 178 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  41.3 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  28.57 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  31.17 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  31.17 
 
 		 181 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  31.51 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  32.88 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5183  hypothetical protein  35.21 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5231  hypothetical protein  32.91 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.376233 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  45 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  27.4 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  33.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5193  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0126  hypothetical protein  36.76 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  30.49 
 
 		 179 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  30.67 
 
 		 175 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  39.62 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  30.39 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  30.49 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  30.49 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  44.19 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  20.22 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  25.68 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5617  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  41.46 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2716  hypothetical protein  31.82 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  32 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1425  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  33.82 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  36.67 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  24.74 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3017  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  27.91 
 
 		 177 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  42.86 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>