More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0906 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 402 aa  816    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  81.28 
 
 		 410 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  79.05 
 
 		 402 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  77.58 
 
 		 404 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  74.81 
 
 		 398 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  73.5 
 
 		 404 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  72.34 
 
 		 404 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  69.5 
 
 		 400 aa  585  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  68.26 
 
 		 398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  67.76 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  66.5 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  59.95 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  57.62 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  59.95 
 
 		 392 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  56.19 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  58.29 
 
 		 394 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  57.11 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  52.7 
 
 		 391 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.38 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  55.58 
 
 		 394 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.24 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.56 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.39 
 
 		 410 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.44 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  52.08 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  49.21 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.08 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  48.18 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  48.18 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.51 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  48.82 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  51.68 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  49.21 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  47.81 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  48.33 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  47.58 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  51.03 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  51.6 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  49.08 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  46.5 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  46.5 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 395 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  49.2 
 
 		 400 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.56 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  45.67 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  45.05 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  47.79 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  46.46 
 
 		 396 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 		 394 aa  346  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 426 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  48.32 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.48 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  43.22 
 
 		 400 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  45.14 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  42.57 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  44.85 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  45.67 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.23 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  44.9 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.46 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  47.59 
 
 		 422 aa  335  7e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.9 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  44.09 
 
 		 403 aa  332  5e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  51.3 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.7 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  41.53 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  42.27 
 
 		 393 aa  324  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.19 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  41.71 
 
 		 379 aa  322  8e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  41.49 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  43.9 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1024  acetylornithine transaminase protein  44.47 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 434 aa  311  9e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  46.27 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.34 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2541  acetylornithine transaminase protein  44.95 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.07 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0798  acetylornithine transaminase protein  43.88 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  41.46 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.7 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  44.41 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  43.88 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2165  acetylornithine transaminase protein  43.35 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0665  acetylornithine transaminase protein  44.62 
 
 		 391 aa  308  8e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.91 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  41.24 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2318  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.76 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.156448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  40.25 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.94 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.53 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.11 
 
 		 386 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  40.69 
 
 		 476 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.53 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>