43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1083 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1132  hypothetical protein  52.58 
 
 		 219 aa  237  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  48.62 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2437  DNA-7-methylguanine glycosylase  46 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000187196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1275  DNA alkylation repair protein  45.45 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0157146  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  36.59 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  35.65 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  32.42 
 
 		 237 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  35.19 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  34.26 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  33.49 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  34.26 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  32.43 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  32.43 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  32.43 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6988  DNA alkylation repair enzyme  32.89 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  32.11 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3095  DNA alkylation repair enzyme  30.32 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1731  DNA alkylation repair enzyme  30.47 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  31.05 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  29.76 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  26.44 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  23.87 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  24.53 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  26.35 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  21.36 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  24.55 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  22.52 
 
 		 263 aa  49.7  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  27.87 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  26.7 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  26.6 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  22.33 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  20.28 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  29.36 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  27.35 
 
 		 243 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  21.66 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  23.89 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>