More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0846 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0846  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 
233 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883508  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.12 
 
 
229 aa  333  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0427  ABC-type metal ion transport system, permease component  70.13 
 
 
231 aa  278  7e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0366  ABC-type metal ion transport system, permease component  64.94 
 
 
231 aa  275  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  56.9 
 
 
232 aa  268  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1638  ABC transporter, permease protein  60.17 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  51.58 
 
 
228 aa  210  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0343  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.98 
 
 
230 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000324678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.75 
 
 
222 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
222 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  45.37 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.95 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
226 aa  171  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.88 
 
 
225 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
224 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 
221 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
225 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.09 
 
 
226 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  47.52 
 
 
217 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  46.34 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  46.34 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  46.34 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
215 aa  144  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  45.85 
 
 
217 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3343  DL-methionine transporter permease subunit  46.83 
 
 
217 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000540247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  45.85 
 
 
217 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3500  DL-methionine transporter permease subunit  46.34 
 
 
217 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000072704  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
230 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
224 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.78 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  44.28 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  41.58 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
221 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
221 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
225 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  39.32 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  41.35 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  45.27 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  41.87 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
235 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
227 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
227 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00197  DL-methionine transporter subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000504385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0202  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0205  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000266103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00196  hypothetical protein  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000400781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
227 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0210  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147429  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0209  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00265437  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0192  DL-methionine transporter permease subunit  44.88 
 
 
217 aa  138  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000747175  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  43.9 
 
 
217 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  41.46 
 
 
223 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
223 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  43.9 
 
 
217 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  43.9 
 
 
217 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  43.9 
 
 
217 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  43.9 
 
 
217 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  41.46 
 
 
223 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
217 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
217 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  40.39 
 
 
225 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  44.78 
 
 
224 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0877  DL-methionine transporter permease subunit  44.66 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000269148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1797  hypothetical protein  45.54 
 
 
215 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  45.54 
 
 
215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
236 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
221 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
221 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  39.71 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45.19 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  39.81 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
224 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
224 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  42.65 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  40.19 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  42.65 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  42.72 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  42.72 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  42.72 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  42.72 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
222 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  44.33 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  44.88 
 
 
223 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
221 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  40.76 
 
 
222 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  40.76 
 
 
222 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  40.76 
 
 
222 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>