129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2425 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2425  competence protein ComGC  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.402709  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1840  late competence protein, exogenous DNA-binding protein  56.6 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.63084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  42.31 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  38.75 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  38.75 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  44.74 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  42.03 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  42.86 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  42.03 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  40.58 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  40.58 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  47.37 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  42.86 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  39.29 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1107  comG operon protein 3  47.56 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4353  comG operon protein 3  44.74 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1600  competence protein ComGC-like protein  46.34 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1634  hypothetical protein  46.34 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.727392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3993  comG operon protein 3  42.11 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1255  competence protein ComGC  42.22 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  25.93 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  31.33 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  40.24 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  40.24 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  27.4 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  27.4 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  30.43 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  38.36 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.93 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  32.79 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  30 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  33.9 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  27.59 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  40.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  28.72 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  40.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15091  Type II secretory pathway, pseudopilin PulG  58.06 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0724154  normal  0.298233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  40.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  37.33 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  30.51 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  34.88 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  55.56 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  29.73 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  29.73 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2835  hypothetical protein  36.78 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.486076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  37.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  48 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  38.46 
 
 		 140 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  28.4 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>