More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2252 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2252  collagenase-like protease  100 
 
 
321 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0724  protease  61.31 
 
 
305 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0741  hypothetical protein  55.59 
 
 
303 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1177  U32 family peptidase  33.44 
 
 
307 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1670  peptidase U32  33.11 
 
 
307 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1704  peptidase U32  33.11 
 
 
307 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.77718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0734  peptidase, U32 family  30.6 
 
 
309 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118856  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4502  peptidase, U32 family  31.23 
 
 
309 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4278  U32 family peptidase  30.6 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4229  peptidase U32  30.28 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.093323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4462  peptidase, U32 family  29.97 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358942 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3095  peptidase U32  30.91 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.134214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4126  U32 family peptidase  29.97 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.301861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4115  U32 family peptidase  29.65 
 
 
309 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4464  U32 family peptidase  29.65 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.380474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4515  peptidase, U32 family  29.65 
 
 
309 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000415029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0968  peptidase U32  31.96 
 
 
309 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2484  peptidase U32  30.28 
 
 
309 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.489664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4610  U32 family peptidase  31.05 
 
 
282 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0570237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  28.16 
 
 
406 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  29.15 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  31.5 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  26.64 
 
 
405 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  28.52 
 
 
411 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  29.14 
 
 
404 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  26.32 
 
 
419 aa  109  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  28.11 
 
 
430 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  26.69 
 
 
411 aa  106  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  24.92 
 
 
412 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  28.41 
 
 
408 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  25.97 
 
 
407 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  27.59 
 
 
411 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  26.64 
 
 
409 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  26.64 
 
 
409 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  25.99 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  26.81 
 
 
439 aa  95.9  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  25.37 
 
 
440 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  27.8 
 
 
783 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  27.02 
 
 
404 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  26.42 
 
 
403 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  25.86 
 
 
413 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  25.78 
 
 
406 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  22.49 
 
 
767 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  25.27 
 
 
412 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  25.99 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  25 
 
 
427 aa  90.5  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  26.09 
 
 
548 aa  90.1  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  25.27 
 
 
439 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  26.99 
 
 
450 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  25.33 
 
 
453 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  25.19 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  25 
 
 
783 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  23.66 
 
 
447 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  25.76 
 
 
438 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  26.04 
 
 
404 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  24.91 
 
 
435 aa  86.3  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  25.84 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1312  peptidase U32  26.18 
 
 
494 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  25.53 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  24.41 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  23.89 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  25.08 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  27.15 
 
 
453 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  27.15 
 
 
453 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  24.38 
 
 
423 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  24.91 
 
 
886 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2206  U32 family peptidase  26.04 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10791  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  22.75 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  24.16 
 
 
872 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  25.42 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4099  peptidase U32  26.85 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  23.94 
 
 
835 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  23.86 
 
 
458 aa  79.7  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  24.77 
 
 
476 aa  79.7  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  22.35 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  23.42 
 
 
426 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  23.53 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  24.65 
 
 
442 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  23.51 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  23.42 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  25.17 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  25.42 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  25.81 
 
 
746 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  25.26 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  26.46 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1232  peptidase U32  28.49 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0266585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  24.67 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  23.33 
 
 
455 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  23.48 
 
 
667 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0977  U32 family peptidase  25.52 
 
 
453 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.51078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  24.75 
 
 
432 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  26.97 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3021  peptidase, U32 family  25.52 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0605791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>