32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1643 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  39.92 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  39.57 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  36.51 
 
 		 274 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  34.13 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  32.65 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  32.75 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  32.38 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  29.78 
 
 		 333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  27.78 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  32.48 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  37.19 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  31.38 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  32.05 
 
 		 266 aa  99.4  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  32.52 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  37.98 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  27.8 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  37.86 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 342 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  30.36 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  34.62 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  29.77 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  33.61 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  29.93 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  30.77 
 
 		 406 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  27.91 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  29.29 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  41.3 
 
 		 143 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>