252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0226 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 401 aa  828    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  62.5 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  62.5 
 
 		 372 aa  498  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  60 
 
 		 375 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  55.41 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  53.85 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  53.08 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  53.33 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  52.82 
 
 		 368 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  52.43 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  50.64 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  49.35 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  47.15 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  43.19 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  42.64 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  42.64 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  40.99 
 
 		 385 aa  303  5.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  33.75 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  32.39 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  29.94 
 
 		 710 aa  182  9.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  32.13 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  28.54 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  28.17 
 
 		 367 aa  173  5e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.13 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  29.01 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  27.18 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  30.89 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.32 
 
 		 391 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  24.42 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.19 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  30.1 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  32.4 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  23.13 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  30.41 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  30.41 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  31.1 
 
 		 319 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  41.86 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  45.33 
 
 		 443 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  45.33 
 
 		 443 aa  53.5  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  40.7 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  32.02 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  40.7 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0686  GTP-binding protein EngA  32.43 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  28.4 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  37.84 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  40.96 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  28.97 
 
 		 287 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  28.97 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0656  GTP-binding protein EngA  32.43 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  35.58 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.47 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  43.42 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  41.67 
 
 		 511 aa  50.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  30.3 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3005  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 490 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  30.3 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  26.63 
 
 		 323 aa  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2733  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 494 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0414  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0317617  hitchhiker  0.000999032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1190  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000499446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1297  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 500 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4597  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 490 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  37.63 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  36.56 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  35.16 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  32.67 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1122  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.827994  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  41.25 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  38.64 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  44.29 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3605  GTP-binding protein EngA  42.86 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  41.25 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>